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ssDNA/RNA環化連接酶商品(pin)屬性:
產品名稱
規格
貨號
ssDNA/RNA環化連接酶
2000U
BJ-PJ6645
ssDNA/RNA環化連接酶
20KU
BJ-PJ6645
商品(pin)介紹(shao):描述: ssDNA/RNA CircLigase 為(wei)熱(re)穩定的(de) DNA/RNA 連接 酶,不(bu)依賴于(yu)(yu) ATP,可催(cui)化(hua)單鏈 DNA 或(huo)單鏈 RNA 的(de)分子內 環(huan)化(hua)。環(huan)化(hua)反應中,要求催(cui)化(hua)底物單鏈 DNA/RNA 具有 5’- 磷酸基團(tuan)和 3’-OH 基團(tuan)。對于(yu)(yu)大于(yu)(yu) 15nt 的(de)單鏈底物,該酶 都(dou)能(neng)高(gao)效的(de)連接。
組分
活性定義:65°C 1h 條件下,催化 1pmol 5’-磷酸化的 ssDNA
底物環化,所需的酶量定義為 1Unit。
儲存:-20℃可保存 3 年。
反應實例
1. 按以下組分配制反應液
CircLigase (100 U/μl) 1 μl
5’磷酸化 ssDNA/RNA 10-100 pmol
10×CircLigase Buffer 2 μl
50mM MnCl2 1 μl
ddH2O Up to 20 ul
65°C 孵育 1h 進行環化反應。
2. 失活反應
反應結束后,可加入終濃度 10mM EDTA 終止反應。或采用
加熱方式 85℃ 10min 加熱失活。
使用注意事項:
(1) 環化底物 ssDNA 或 RNA 必須帶有 5’磷酸基團,3’端含有 OH。
(2) 環化體系中的 ATP 濃度高于 20μM 以上時會極大抑制環化效率,甚至導致環化失敗。因此建議底物為純化產物。
(3) 由于本酶提高了耐熱性,在 65℃條件下進行連接反應,測試中 Betain 無益于連接效率提升。
(4) 本酶主要進行分子內環化連接,分子間的連接未檢測到。
(5) 本酶對 ssDNA 和 RNA 的環化效率極高,多數情況下,90%以上的底物被環化。未被環化的 ssDNA 可通過加入 5U的 Exonuclease I,37°C 消化 15min 去除,以獲得高純度的環化 ssDNA。未環化的 ssRNA,將稍后給出去除方案。
(6) 本酶可以連接 15nt 以上的核苷酸,更長的產物連接參數, 將稍后給出測試報告及 protocol。
(7) 對于連(lian)接(jie)底物(wu)量較少的(de)(de)實驗來講,推薦縮小(xiao)體系(xi),而不是減(jian)少酶的(de)(de)用(yong)量。在小(xiao)體系(xi)實驗時(shi)注意體系(xi)的(de)(de)蒸(zheng)發(fa),可加入礦物(wu)油以防止蒸(zheng)發(fa)。
